PROJET SEP 349 ( Sud Expert Plantes)

( 2008- 2010) 

BAMBOUS D’INDOCHINE 

Utilisation de l'informatique pour transmettre l'expertise taxonomique et les connaissances vernaculaires .

 Pays porteur du projet :   Vietnam

Coordinateur du projet :   DIEP My Hanh

Institution de rattachement du coordinateur de projet :   Université Nationale de Ho Chi Minh

Université des Sciences Naturelles de Ho Chi Minh ville ( USN)

ECOMUSEE BAMBOU ET CONSERVATOIRE BOTANIQUE DE PHU AN

( = Centre de Recherche pour la Conservation des ressources naturelles = Lang Tre Phu An) 

Rappel succinct des activités 2008 :  

En 2008, le projet SEP Bambou d’Indochine a réalisé les points importants suivants:

- La liste des descripteurs des bambous a été arrêtée à 91 descripteurs. Une partie des informations collecté es sur les taxons vernaculaires a été informatisée grâce à un logiciel adapté à la gestion des descriptions taxonomiques, Xper2, version 1.92.

-  Une formation pour l’utilisation du logiciel XPER2, organisé au Viet Nam par le Conservatoire des bambous de Phu An avec les 3 pays participants (Cambodge, Laos et Viet Nam), 4 personnes pour chaque pays, intervenant pour la formation : Pr. Régine VIGNES- LEBBE et pour l’organisation, Dr. DIEP My Hanh.

- Participation au « 1° Symposium de la Flore du Cambodge, du Laos et du Viet Nam », à Phnom Penh en 12/2008 organisé par le Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris et l’Université Royale de Pnomh Penh avec  une présentation orale sur le projet Bambou et deux  posters concernant le projet SEP.

-     Une publication sur le projet SEP Bambou sur la revue de l’IRD.

-    Une mission de prospection des bambous du Cambodge et du Laos a été réalisée avec un groupe composé de 5 chercheurs du  Viet Nam- 1 du Cambodge et 1 du Laos au Cambodge et plus trois du Laos pour la prospection au Laos, du 7/12/2008 au 29/12/2008.  18 taxons au Cambodge et 22 taxons du Laos ont été collectés.

-     Informatisation sur 185 taxons scientifiques, 28 taxons vivants dans le conservatoire et 93 taxons vernaculaires de l’herbier ont été codés.

-      Evolution de la liste des descripteurs suite au retour d’expérience de la description des taxons (scientifiques et vernaculaires) effectuée lors de la première année.

-      Une mission de Dr. Soejatmi Dransfield à Paris MNHN (du 4/5/2009 au 9/5/2009) a permis de faire la révision des herbiers du Viet Nam,  Laos et Cambodge avec Dr. Diep My Hanh.

-     Une mission de prospection des bambous sur les Hauts Plateaux du Viet Nam a été réalisée avec un groupe composé de 5 chercheurs du  Viet Nam, du 6/9/2009 au 14/09/2009, 22 taxons sur les Hauts Plateaux ont été collectés dont deux spéciaux qui font l’objet de deux articles avec Dr. S. Dransfield (articles en préparation).

-     Une mission de prospection des bambous de l’archipel de Con Dao : sur les îles des Petits et Grands bambous, essentiellement des bambous épineux, d’assez faible diamètre ; sur l’île principale, deux massifs de Schizostachyum. Au total, une dizaine d’échantillons a été collectée pour l’herbier;

-     Première interprétation sur la connaissance phylogénique du bambou à partir des coupes anatomiques des branches secondaires de 16 espèces correspondant à 7 genres différents (Dang Le Anh  Tuan et al., nov. 2009).

-      Informatisation :

      Nous disposons actuellement de 540 taxons scientifiques et vernaculaires décrits de façon structurée et standardisée.

     -          Publications en cours :

o        Liste définitive des descripteurs et des états

        (proposition d’une description standard et structurée des bambous).

o       Un bambou rampant (scrambling) à  Bach Ma de la province de Thua Thien Hue .

o       Un bambou épineux, plein, à Pleiku, Hauts Plateaux du Viet Nam.

 -          Formation :

o       Nguyen Ha Phuong, master Systématique, Evolution Paléobiodiversité (SEP) à l’UPMC (Paris), master 2  en cours d’achèvement.

Master 1, sujet : « Caractères morpho-anatomiques des bambous en vue d’une révision de la flore du Cambodge- Laos et Viet Nam ».

Master 2, sujet : "Démarche pour identifier des bambous du Viet Nam".

o       Nguyen thi Bich Loan, master en Ecologie et Environnement, USN.

Sujet : « Comparaison entre deux genres Bambusa et Dendrocalamus à l’aide du logiciel XPER2 ».

o       Tran van Tien, participant au projet, en cours de formation (doctorat en Chine sur le genre Schizostachyum).

1. Objectifs du Projet Bambous d’Indochine:

- Le premier objectif scientifique du projet  consiste à réviser les travaux de E.G. et A. Camus et les travaux taxonomiques sur les bambous du Viet Nam et des pays voisins (Cambodge et Laos) tels qu’ils figurent dans la « Flore générale de l’Indochine » (1923).

 - Le deuxième objectif scientifique du projet est de valoriser  l’ensemble des informations disponibles grâce à l’informatique et à une validation scientifique des données. Cela aboutira à la réalisation d’une flore électronique des bambous d’Indochine intégrant connaissances scientifiques et vernaculaires. 

 - Le troisième objectif du projet est une contribution à la gestion durable des bambous. L'exploitation industrielle des bambous existe déjà et va s'accélérer avec la multiplication des nouvelles utilisations. Cette exploitation se fait de façon plus ou moins anarchique et  la réalisation du projet va permettre de proposer à terme une aide à l’expertise taxonomique pouvant contribuer à des suivis d’inventaires et à l’élaboration de mesures de gestion durable. La rapidité de mise en exploitation d'une plantation de bambous autorise à envisager des mesures réglementaires ce qui va nécessiter la formation de spécialistes en plantation des espèces recherchées par les industriels et en identification des bois de bambou ; le projet apportera un outil de connaissance utilisable dans ce contexte.

  2. Partenariats :  

  3. Méthodologie et moyens mis en œuvre :

 a/ Collecte des informations

Il s’agit de procéder sur le terrain à l’inventaire des différents bambous existants, faire leur description et s’informer auprès des populations de leur utilisation. Des échantillons sont collectés pour la constitution des herbiers et éventuellement la plantation au Conservatoire de Phu An.

b/ Informatisation des taxons vernaculaires

L’ensemble des informations collectées sur les taxons vernaculaires sera informatisé grâce à un logiciel adapté à la gestion des descriptions taxonomiques, Xper2.

c/ Analyse et identification scientifique des taxons vernaculaires

Sur chacune des bases de connaissances régionales, les taxons vernaculaires seront analysés par comparaison automatique des descriptions avec recherche des caractères discriminants et calcul des similarités ; des regroupements inter ou intra régionaux pourront alors être proposés, comparés à la littérature scientifique et aux spécimens des collections. Grâce aux fonctionnalités d’identification du logiciel Xper2, des spécimens d’herbier déjà déterminés seront  identifiés à tel ou tel taxon vernaculaire de la base de connaissances.

Une fois identifiés scientifiquement, les taxons vernaculaires correspondant à une même espèce seront réassociés dans la base de connaissances. L’informatique sera alors utilisée pour construire les descriptions résultant de cette fusion en préservant la discrimination taxonomique.

e/ Test et validation de la base de connaissances

La base de connaissances terminée, elle devra être documentée et testée à la fois quant à la validation de son contenu scientifique et à la bonne compréhension des termes et de l’utilisation du système d’identification assistée par ordinateur.

4. Travaux réalisés :

Une grande partie des informations collectées sur les taxons scientifiques, les herbiers et les taxons vernaculaires est informatisée.

4.1 -  Contexte et difficultés rencontrées :

- La reprise  des données de la littérature nécessite d’approfondir aussi la nomenclature, et  ce travail s’avère plus long que prévu.

- Les observations doivent être comparables et même réalisées par la même personne pour limiter les déviations d’interprétation ; même pour une même équipe déjà formée,  il y a toujours des différences d’appréciation  qui nécessitent  une vérification par une seule personne. 

4.2 -  Missions : 

- Une mission sur les Hauts Plateaux a été effectuée du 6/9 au 14/09/2009.
- Missions de prospection des bambous de l’archipel de Con Dao (octobre 2008 et août 2009). 

4.3 – Résultats :

 a. Aspects pédagogiques :  

       -    Mise à jour de la Flore de l’Indochine de 1923 en cours.

-      Création d’une équipe spécialisée sur le bambou d'Indochine par la formation des jeunes (1 doctorant et 2 masters en cours).

-       Disposition d’une flore informatique : rassemblement des premiers éléments.

-      Compléter le travail de terrain et l’échantillonnage des bambous : travail entrepris au Cambodge et au Laos, essentiellement le long du Mékong ; au Viet Nam l’archipel de Con Dao a été prospecté et une mission complémentaire a été effectuée sur les Hauts Plateaux.

-     Identifier les spécimens locaux connus sous leurs noms  vernaculaires avec les noms scientifiques : les botanistes ne sont pas toujours d’accord pour donner un nom scientifique  définitif à tel ou tel bambou ;  dans la littérature les descripteurs pris en compte sont en nombre trop limité pour permettre une comparaison avec les descriptions effectuées dans le cadre d’Xper2 ; ce travail s’avère donc long et difficile, et il faudra sans doute constituer des comités de taxonomistes pour le faire progresser.

-     Accumuler des informations sur les données écologiques liées aux bambous : c’est l’objet des fiches établies lors des prospections.

-      Inclure de nouveaux spécimens dans les herbiers (Paris, Kew, Viet Nam) : systématiquement à l’occasion des prospections, sont collectés suffisamment d’échantillons pour pouvoir constituer plusieurs herbiers.

-      Compléter la collection vivante existant à Phu An, représentative de la région d’Indochine : une partie des bambous collectés au Cambodge et au Laos ont fait l’objet de bouturage dans la pépinière du conservatoire de Phu An mais les reprises n’ont pas réussi à 100%.

Documentation (écrite et illustrée) dans la base Xper2 des caractères morphologiques qui servent à distinguer les taxons de Bambusoideae (genres, espèces, taxons vernaculaires).

              - Conservatoire du bambou du Viet Nam

              - Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris.

              - Université Royal de Pnomh Penh du Cambodge

              - Université Forestier du Laos.

Aux 40 spécimens du Cambodge et du Laos collectés en décembre 2008 sont venus s’ajouter 22 nouveaux spécimens des Hauts Plateaux du Viet Nam et une dizaine de l’archipel de Con Dao.

             *  Visites sur le site Internet: 

En explorant l’ensemble des informations sur les bambous d’Indochine (utilisations, distributions, noms vernaculaires …), quelques industriels ont pris contact avec le Conservatoire ( Centre  de recherche pour la conservation des Ressources naturelles) pour se renseigner sur les bambous susceptibles d’être utilisés en phytoremédiation ou pour envisager des plantations de milliers d’hectares pour pouvoir disposer de la matière première nécessaire à leur industrie ;  le traitement des eaux d’une tannerie implantée au Viet Nam va être mis en place dans les prochaines semaines ; des essais de phytoremédiation au Maroc ;  différentes variétés doivent être proposées pour une plantation de 45.000 hectares nécessaires à l’approvisionnement d’une industrie du bois à base de bambous.

  5. Perspectives : 

- La base des descripteurs permet de définir les caractères morphologiques d’un spécimen de bambou. Le logiciel est disponible et peut être chargé sur le site web de :

http://lis-upmc.snv.jussieu.fr/lis/?q=fr/ressources/logiciels/xper2 .

- La base des descripteurs est en cours de mise au point.; elle sera disponible sur le  site web du conservatoire du bambou après sa publication.

 http://www.ecobambou-phuan.org/ 

- Séquençage moléculaire des taxons des bambous collectés au Viet Nam et de la partie des taxons du Cambodge et du Laos disponibles.

- Deuxième formation à l’utilisation du logiciel Xper2 par le Professeur Régine Vignes- Lebbe  pour effectuer les comparaisons et déterminer les caractères discriminants sur tous les échantillons collectés et codés ( 2010 au VietNam).

- Projet de l’Université Nationale du Viet Nam sur l’étude de la biodiversité des bambous et leur utilisation. A partir des résultats du projet SEP, l’Université Nationale a accordé un projet de recherche (2010- 2013)  afin de  poursuivre la recherche sur le bambou. Responsable du projet : Dr. Diep thi My Hanh  avec  la participation du Pr. Régine Vignes- Lebbe,  du Dr. S. Dransfield, du Dr. Thomas Haevermans et d’autres collègues.

 - Lancer un projet de développement durable pour le Viet Nam, à partir des bambous étudiés dans le cadre du projet SEP, dans la région de Thanh Hoa.

 - Développer un projet de recherche  en coopération internationale pour le conservatoire de bambou ; projet de l’Université d’UKLAN ( Angleterre).